我院专家团队研发人工智能赋能PCR新技术,实现口腔微生物精准检测与定量分析

信息来源:实验研究部     作者:蒋兴䘵     发布时间:2026-01-21     点击:0

近日,我院蒋兴禄博士团队在国际权威期刊Analytical Chemistry(中科院一区TOP期刊、Nature Index)上发表了题为“AI-Assisted Multiplex SYBR Green I-based qPCR for the Identification and Quantitative Analysis of Oral Microbiota”的最新研究论文。该研究的共同第一作者为我院硕士研究生隆澳与博士后陈文瑨,蒋兴禄博士为通讯作者。此项成果标志着团队在其首创的“速度控制PCR(VC-PCR)”技术体系上取得了关键性升级——深度融合人工智能(AI),成功构建了一套智能化、高通量、定量化的多重病原体检测系统,并率先应用于口腔微生物群落的高精度诊断。

本研究是建立在团队前期两项核心技术之上的突破:

1.建立VC-PCR新方法:团队此前创新性地利用牛血清白蛋白(BSA)水凝胶控制Taq酶的释放,将PCR的指数扩增转变为持续20个循环以上的线性扩增,为精确控制扩增效率奠定了基础。(文章发表于Chemical Engineering Journal,中科院一区TOP期刊,DOI10.1021/acs.analchem.3c03637

2.实现无标准曲线定量检测:基于线性扩增动力学,团队开发了反向计算数学模型,实现了无需标准曲线的DNA绝对定量,显著简化了流程并提高了低浓度模板检测的准确性。(文章发表于Analytical Chemistry,中科院一区TOP刊,DOI10.1021/acs.analchem.3c03637

本次升级:人工智能赋能多重检测同时检测多种病原体(多重PCR)时,复杂的扩增曲线使得人工分析效率低下、误差增大。针对此挑战,本次研究进行了人工智能的深度整合,利用AI算法对多重VC-PCR产生的复杂扩增曲线进行智能解析。研究以三种常见致龋菌(粘性放线菌、嗜酸乳杆菌、变异链球菌)为模型,在结合机器学习及专家系统等算法后,显著提高了二重和三重pcr的半定量和定量准确率。这些AI模型能够自动、精准地从重叠的荧光信号中提取特征,进行鉴定与定量,克服了传统多重qPCR对荧光通道数目、昂贵探针的依赖,以及人工判读的主观性与低效性。

该技术已申请国家发明专利,为快速、低成本、高通量的病原体同步检测提供了全新的“AI+分子诊断”解决方案。它不仅适用于口腔微生物生态和龋病风险的评估,其通用性设计也便于拓展至呼吸道、肠道菌群检测及多种传染病的联合诊断领域。此项成果的取得,体现了“方法创新-模型突破-应用智能化”的完整科研链条,是交叉学科融合推动临床诊断技术进步的典型案例。研究工作获得了国家自然科学基金及医院相关项目的支持。

我院专家团队研发人工智能赋能PCR新技术,实现口腔微生物精准检测与定量分析 第 1 张



20260119图1.png

正常qPCR、单重VC-PCR与多重VC-PCR扩增效果的比较

 

20260119图2700.png

二重VC-PCR不同扩增阶段标准曲线绘制&绝对定量结果